De nombreuses familles remarquent pour la première fois le groupe de complémentation A de l’anémie de Fanconi au début de l’enfance, lorsqu’un enfant est plus petit que ses pairs, présente des ecchymoses facilement ou a des saignements de nez fréquents ou des infections qui ne correspondent pas aux rhumes et aux bobos habituels. Les médecins sont souvent alertés par des caractéristiques présentes à la naissance ou durant la petite enfance — comme des anomalies du pouce ou de l’avant-bras, des taches cutanées « café-au-lait », ou des anomalies rénales et cardiaques — ou par des résultats anormaux aux tests sanguins effectués chez le nouveau-né ou précocement. Parfois, les premiers signes du groupe de complémentation A de l’anémie de Fanconi apparaissent plus tard, lorsque des analyses de routine révèlent une baisse des lignées sanguines ou lorsque la croissance et la puberté semblent retardées par rapport aux camarades de classe.